Pohjois-Pohjanmaan sairaanhoitopiirin kuntayhtymän perussopimuksen lisäksi noudatetaan kuntayhtymän toiminnassa hallintosäännön määräyksiä, jossa säädetään kuntayhtymän päätöksenteko- ja kokousmenettelystä ja viranhaltijaorganisaatiosta.
Lisäksi kuntayhtymän toiminnassa noudatetaan
- valtuuston työjärjestystä
- taloussääntöä
- tarkastussääntöä
- luottamushenkilöiden palkkio- ja matkustussääntöä.